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    - Traitement de séquences
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    - Classifications évolutives
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      Primates

    - Lecture d'un arbre phylogénétique. Notion d'ancêtre commun

    - La place des fossiles dans les arbres phylogénétiques

    Documentation

    Lecture d'un arbre phylogénétique
    La notion d'ancêtre commun

    Un arbre phylogénétique est un arbre de parenté, qui permet de déterminer les groupes frères. Il est obligatoirement associé à la matrice taxons/caractères qui a permis de le construire en utilisant les principes de la méthode cladistique, et qui doit préciser les innovations évolutives qui ont permis de l'établir. 

    Ancêtre commun et innovation évolutive
     
    • les ronds blancs correspondent aux populations de derniers ancêtres communs à deux groupes frères
    • les ronds de couleurs correspondent aux innovations évolutives (apparues chez des ancêtres communs)
    Chaque branche de cet arbre doit être justifiée par une nouveauté évolutive (apparition, disparition ou transformation d'un caractère). Cette innovation évolutive est apparue chez un organisme qui l'a transmise à tous ses descendants ; cet organisme est donc un ancêtre commun hypothétique exclusif à tous les organismes possédant cette innovation évolutive. 

    Les noeuds de l'arbre représentent des populations d'ancêtres communs à partir desquels une divergence va s'observer entre ceux qui vont avoir acquis une nouveauté évolutive et ceux qui ne l'acquerront pas. 

    Les caractéristiques du dernier ancêtre commun

    Le dernier ancêtre commun à deux groupes frères se situe au noeud à la base de ces deux groupes. Quelques unes de ses caractéristiques peuvent être précisées en fonction des informations fournies par l'arbre. Ainsi, d'après l'arbre ci-dessus, on peut dire que le dernier ancêtre commun au Crocodile et à l'Aigle possédait : des mâchoires, des poumons, un amnios et une fenêtre mandibulaire.