2 - Les cytochromes d'autres espèces :
On s'intéresse à différentes formes du vivant : On peut comparer leurs cytochromes entre eux 

Bilan : Les cytochromes de différentes espèces à travers le Vivant (Procaryotes tels que des bactéries, Eucaryotes tels que végétaux chlorophylliens, Vertébrés) présentent une forte ressemblance dans leur structure tridimensionnelle : nombre et position des hélices, "poche" renfermant le hème.

On veut déterminer de la même façon que précedemment les acides aminés susceptibles d'intervenir dans le maintien du hème dans la "poche"chez :
Rhodopseudomonas
Pseudomonas
Desulfovibrio
Paracoccus
Riz
Bonite (Poisson)
Cheval

Bilan Tableau des résultats comparés
 

Les aspect évolutifs


Les cytochromes existent chez les Procaryotes depuis plus de 2.5 Ga (Ga = millards d'années). On considère qu'ils dérivent tous d'une molécule ancestrale commune donc que les gènes qui les codent sont issus d'un gène ancestral commun.
On cherche les modalités de l'évolution de ces molécules.

1 - Analyse d'un alignement multiple des séquences polypeptidiques de ces divers cytochromes :

Réaliser l'alignement multiple avec Anagène
Obtenir les résultats

On peut se demander pourquoi au cours de l'évolution certains acides aminés ont été systématiquement conservés.

2 - Recherche d'une explication à la conservation de certains acides aminés au cours de l'évolution :

On se propose de rechercher, pour chaque molécule, la position dans la séquence de ces acides aminés.(Attention ! on considèrera la position réelle. Un tiret est une position fictive créée pour optimiser l'alignement).

Réaliser l'alignement multiple avec Anagène
Obtenir les résultats

Bilan :
On constate que 3 sur 4 des acides aminés systématiquement conservés au cours de l'évolution interviennent dans la fixation du hème.

Comment expliquer ce constat sachant que les mutations sont aléatoires ?

Il n'est pas réaliste d'envisager que l'information génétique codant pour ces acides aminés n'a jamais été affectée par des mutations.
On peut par contre imaginer qu'un changement parmi ces acides aminés n'a plus permis le maintien du hème au sein de la molécule. Le cytochrome, alors inactif, a perdu son activité, vitale pour la cellule.
Une telle mutation n'a donc pu être transmise.

Hypothèse explicative :

Toutes les mutations ayant entrainé une modification parmi les acides aminés assurant le maintien du hème dans la "poche" ont vraisemblablement eu pour conséquence une altération de la fonctionnalité de la molécule de cytochrome concerné.
Les individus porteurs de telles mutations ont été éliminés par sélection naturelle.
Les mutations à l'origine d'avantages ou de désavantages sélectifs sur lesquels s'exercent la sélection naturelle sont un moteur de l'évolution.

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